El intestino humano es el hogar de un continuo equilibrio entre la respuesta inmunitaria del huésped, una gran comunidad de bacterias residentes y una capa epitelial unicelular que funciona para mantener una barrera entre ellas. Las alteraciones de este delicado equilibrio pueden provocar una inflamación crónica y aguda, que es una causa importante de causa de morbilidad y mortalidad en todo el mundo. En particular, los neutrófilos desempeñan un papel crítico: una alta densidad de ellos presente en las grandes heridas epiteliales actúan como precursores de las lesiones ulceradas características de la enfermedad inflamatoria del intestino (EII).  

La glicoproteína P (P-gp) desempeña un papel fundamental en la protección de los epitelios intestinales al mediar el eflujo de fármacos/xenobióticos desde la mucosa intestinal hacia la luz del intestino. Estudios recientes han puesto de manifiesto que la P-gp también confiere un vínculo crítico en la comunicación entre la función de barrera de la mucosa intestinal y el sistema inmunitario. Sin embargo, a pesar de que se sabe desde hace más de 10 años que la P-gp desempeña un papel central en la homeostasis gastrointestinal, el mecanismo molecular preciso que controla su expresión funcional y su funcionamiento aún no se conoce.

Investigadores de la Universidad de Bath y la Facultad de Medicina de la Universidad de Massachusetts identificaron un "núcleo funcional" del microbioma de la comunidad intestinal, concretamente géneros de las clases Clostridia y Bacilli necesarios para la inducción de la P-gp en el epitelio intestinal en modelos de ratón. En general, se identificó un vínculo en la mecánica entre los resultados funcionales cooperativos de la comunidad microbiana y la modulación de la P-gp, un componente epitelial, que funciona para suprimir la inflamación hiperactiva y mantener la homeostasis intestinal. El análisis metagenómico de esta comunidad microbiana central reveló que la producción de ácidos grasos de cadena corta y ácidos biliares secundarios se asocian positivamente con la expresión de la P-gp. Además, estas dos clases de metabolitos derivados de la microbiota regulan de forma sinérgica su expresión y función. 

También se descubrió que en los pacientes que padecen colitis ulcerosa (CU) existe una disminución de la expresión de la P-gp unida a la reducción de endocannabinoides antiinflamatorios derivados del epitelio y del contenido luminal (por ejemplo, microbios o sus  metabolitos) con una capacidad reducida para inducir la expresión de la molécula.